Jürgen Becker ist seit 1997 Direktor der Poliklinik für Zahnärztliche Chirurgie und Aufnahme der Westdeutschen Kieferklinik des Universitätsklinikums Düsseldorf. Von 2001 bis 2003 war er 1. Vorsitzender der Arbeitsgemeinschaft für Kieferchirurgie der DGZMK. Derzeit ist er Vorsitzender der Arbeitsgruppe „Anforderungen an die Hygiene in der Zahnmedizin" der Kommission für Krankenhaushygiene und Infektionsprävention am Robert Koch-Institut in Berlin und Mitglied der Arbeitsgruppe „Richtlinien nach Röntgenverordnung" der Strahlenschutzkommission beim Bundesumweltministerium.